Indemnités journalières non versées après un arrêt de travail : quels recours et quels délais ?

Publié le 7 juillet 2026

Si votre caisse d'assurance maladie n'a pas versé vos indemnités journalières après un arrêt, vous pouvez contester la décision dans les délais prévus par la loi.

Indemnités journalières non versées après un arrêt de travail : quels recours et quels délais ?

Si vous avez bénéficié d'un arrêt de travail mais n'avez pas reçu les indemnités journalières (IJ) auxquelles vous pensiez avoir droit, plusieurs explications sont possibles : la caisse considère que vous ne remplissez pas les conditions, elle conteste le motif médical, ou un délai de traitement administratif s'est prolongé. Vous disposez de recours spécifiques pour contester cette situation, selon que le refus est implicite ou explicite.

Les motifs courants de non-versement des indemnités journalières

La caisse d'assurance maladie peut refuser les IJ si vous ne justifiez pas d'une durée d'affiliation suffisante (en général, 60 jours de cotisation dans les 3 mois précédant l'arrêt pour les salariés du régime général). Elle peut également contester l'origine professionnelle de l'arrêt, ou considérer que votre arrêt ne satisfait pas aux conditions légales. Parfois, elle vous demande des pièces complémentaires (feuille de soins, certificat médical plus détaillé) avant de statuer.

Vérifier la décision et le délai d'appel

La caisse doit vous notifier son refus par écrit. Si vous ne recevez rien après 2 à 3 mois, il s'agit d'une décision implicite de rejet. Dans les deux cas, vous pouvez contester dans un délai de deux mois à compter du jour où vous avez appris le refus. Ce délai est strict : au-delà, votre recours risque d'être irrecevable.

Les étapes du recours contentieux

Vous devez d'abord adresser une réclamation écrite à votre caisse avec les éléments justifiant votre droit (documents d'affiliation, certificat médical, preuves de salaire). Si la caisse maintient son refus ou ne répond pas sous un délai raisonnable, vous pouvez saisir la Commission de Recours Amiable (CRA) de la caisse, qui réexamine votre dossier. Passé ce stade, il est possible de contester devant le Tribunal de l'Ordre Social.

Les documents à réunir pour votre dossier

Rassemblez votre notification de refus (ou courrier de la caisse), le certificat médical original, vos fiches de paie justifiant l'affiliation, un relevé de vos cotisations, et tout élément prouvant votre situation professionnelle au moment de l'arrêt. Si vous contestez le refus au motif que la caisse n'a pas reconnu l'origine de l'arrêt, une demande de reconnaissance en maladie professionnelle ou en accident du travail peut être utile.

Générer un courrier de réclamation adressé à votre caisse, l'envoyer en recommandé et en conserver une trace peut accélérer le traitement : c'est une première étape documentée de votre contestation, que Plimo peut vous aider à structurer et à transmettre.